Das Gen, dass für die Zeichnung von Farbratten maßgeblich verantwortlich ist, liegt auf dem H-Lokus auf dem Chromosom 14 im Bereich des KIT-Gens, das in vielen verschiedenen Tierarten Scheckung (Piepaldism) verursachen kann.
Das Besondere am H-Lokus gegenüber anderen Genorten, die für die Fellfarbe der Farbratte verantwortlich sind, ist, dass es nicht nur zwei Allele gibt, die diesen Genort besetzen können. Neben dem dominanten H, das eine durchgehende Färbung ohne weiße Abzeichen (sogenannte Self-Zeichnung) ausprägt, und dem rezessiven h, das im homozygoten Fall eine Hooded-Zeichnung verursacht (Farbiger Kopf, Hals, Brust, Schultern und ein breiter, gleichmäßig dicker Streifen über den Rücken bis zur Schwanzspitze), gibt es noch weitere Allele:
- hi Hooded Irish
- hn Hooded notched
- he Hooded extreme
- Hre Hooded restricted
Alle diese Allel liegen auf dem selben Genort und verhalten sich in dem meisten Kombinationen kodominant. Das bedeutet, dass sich die unterschiedlichen Allele bei einem heterozygoten Tier gleich stark auf den Phänotyp auswirken. Beide Allele werden dabei voll exprimiert. Das bedeutet, dass die unterschiedlichen Kombinationen von jeweils zwei der Allele H, h, hi , hn ,he und Hre zu unterschiedlichen Mustern führt. Abweichend vom kodominanten Erbgang ist die Wildform H (keine Zeichnung) über alle weiteren Allele dominant und h ist rezessiv gegenüber hi . Außerdem ist das restricted Allel homozygot lethal.
Der Farbanteil, der durch diese Allele exprimiert wird, verhält sich wie folgt (von viel Farbe und geringem Weißanteil zu wenig Farbe und hohem Weißanteil): H> hi > h > hn >he > Hre
Es handelt sich hierbei nicht - wie zunächst von Castle (1914) angenommen- um Modifier, die von einem anderen Genort die Exprimierung des Hooded Gens beeinflussen, sondern um eigenständige Alle auf dem H-Lokus im Sinne eines Polymorphismus. Die Vorstellung, dass einer oder mehrere Modifier ein Gen auf dem H-Lokus "befallen" (und zwar entweder das dominante H oder des rezessive h) ist falsch (siehe Darstellung auf Farbrattengenetik.de.tl), da es die Allele selbst sind, die auf diesem Genort liegen.
Desweiteren wird angenommen, dass die Vererbung einer Variante der Husky-Zeichnung (Englisch "Roan", wird auch als "Essex" bezeichnet) über den H-Lokus läuft. Verursacht werden soll sie durch das Roan-Allel hro oder Hro , wobei es unterschiedliche Angaben dazu gibt, ob dieses Allel dominant und im homozygoten Fall lethal (NFRS) oder unvollständig rezessiv (Testverpaarungen) ist. Bei der Betrachtung der Genetik von Huskies muss zwischen Europäischen und US-Tieren unterschieden werden, da diese wahrscheinlich eine abweichende Genetik haben (Curiosity Rats). So wird zusätzlich ein eigenständiger Genort für die Kodierung eines dominant-rezessiven Husky-Erbgangs diskutiert.
Zusätzlich zum H-Lokus gibt es mindestens einen weiteren Genort, der tatsächlich in Form eines Modifiers die Expression der Allele auf dem H-Lokus beeinflusst. Auf dem Genort Hm können die Allele Hms (kurze Rückenzeichnung) und Hml (lange Rückenzeichnung) liegen. Für sich genommen können diese Allele keine Zeichnung phänotypisch ausprägen, beeinflussen aber die Expression der Alle auf dem H-Lokus.
Aus den vorangehenden Betrachtungen ergeben sich vielfältige Kombinationsmöglichkeiten, die teilweise zu ähnlich aussehende Phänotypen bei unterschiedlichen Genotypen führen können und sie oft nicht einer Mendel-Genetik folgen.
Mögliche Allel-Kombinationen für bestimmte Zeichnungen sind im Folgenden aufgeführt:
| Bareback | hh oder hhe oder hHms oder hhi |
| Berkshire | Hh oder hhe oder hihi oder hihn |
| Blazed | viele Kombinationsmöglichkeiten |
| Capped | hnhn |
| Capped Stripe | hreh oder Hrehre (lethal?) |
| English Irish | Hh oder Hhi |
| Hooded | hh oder hml |
| Irish | Hh oder Hhi |
| Masked | hehe |
| Variegated | ? |
Daumenregel zur Vererbung von Zeichnungen
Bezüglich der Vererbung und phänotypischen Ausprägung der Hooded-Allele und Modifier liefert die AFRMA folgende Daumenregel.
Man nimmt folgende Ebenen an:
- Self
- English Irish (Fleck auf der Brust)
- American Irish (Fleck auf dem Bauch) und Berkshire
- Hooded, Variegated und Bareback
- Masked, schiefe Kopfzeichnungen und Black Eyed White (bzw. Pink Eyed White und Red Eyed White bei entsprechenden anderen Grundfarben)
Ratten mit Zeichnungen der selben Ebene können alle Zeichnungen dieser Ebene und einer Ebene höher erzeugen.
Ratten aus direkt aufeinander folgenden Ebene (also z.B. Ebene 1 mit 2, Ebene 2 mit 3 und so weiter) können die Zeichnungen erzeugen, die diesen beiden Ebenen entsprechen.
Ratten, deren Ebenen durch eine Ebene getrennt sind (also z.B. Ebene 1 mit 3, Ebene 2 mit 4 und so weiter) werden vor allem Zeichnungen der dazwischen liegenden Ebene erzeugen (also z.B. bei Ebene 1 mit 3 die der Ebene 2), aber auch eine kleine Zahl von Nachkommen der eigenen Ebene (also z.B. bei Ebene 1 mit 3 die der Ebene 1 und 3).
Ratten, deren Ebenen durch zwei oder mehr Ebenen getrennt sind (also Ebene 1 mit 4, Ebene 1 mit 5 und Ebene 2 mit 5) werden Nachkommen mit Zeichnungen der dazwischen liegenden Ebenen (also z.B. bei Ebene 1 mit 4 die der Ebenen 2 und 3), aber nicht ihrer eigenen Ebenen erzeugen.
Bitte beachten: es handelt sich um eine grobe Daumenregel, nicht um gesicherte genetische Erkenntnisse!
Unterschiedliche Ausprägungen der verschiedenen Hooded Allele. Quelle: Castle (1914).
Capped bzw. Notched Ratte. Genotyp: hnhn. Quelle: Castle (1914)
Hooded Ratte. Genotyp: hh oder hml.Quelle: Castle (1914)
Irish Ratte. Genotyp: Hh oder Hhi. Quelle: Castle (1914)
Verpaarungsexperiment. Eine wildfarbene Ratte (8000) wird mit einer Black Hooded (6176) verpaart. 8021 und 8018 stammen aus der F1. In der folgenden Generation spalten sich die Merkmale teilweise auf. 8075 ist eine Black Hooded mismarked, 8076 und 8077 sind Berkshires, 8078 ist eine Irish. Quelle: Castle (1914)
Verpaarungsexperiment. Quelle: Castle (1914)